Le laboratoire d'Agro-physiologie fédère trois équipes de recherche autour d'une thématique commune qui concerne l'évaluation de la qualité des matières premières et produits agricoles. Ainsi de façon pluridisciplinaire les travaux du laboratoire déclinent la notion de « qualité » le long des filières en caractérisant la matière première en termes d'aptitudes intrinsèques (germination, vigueur de semences), technologiques lors de la transformation, et de propriétés positives ou négatives vis-à-vis de la santé du consommateur.